行政院長蘇貞昌上週末召開防疫會議，外界質疑防疫多頭馬車。對此，蘇揆今天(27日)受訪時表示，「這是誤會」，衛福部長陳時中一直都是防疫指揮官，有需多事情需要跨部會合作，必須在行政院指揮下統合調度，形成共識。

部立桃醫群聚感染擴大，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中24日接連召開兩場記者會，決定擴大隔離，而行政院長蘇貞昌當天也在行政院召開防疫會議，和陳時中就防疫研商對策。外界質疑，蘇揆召開會議讓防疫指揮官角色重疊，防疫陷入多頭馬車。

對此，蘇貞昌27日受訪時表示，這是誤會，陳時中就是防疫指揮官，但有許多事情需要跨部會合作，必須在行政院的指揮下統合調度。蘇貞昌表示，陳時中在防疫第一線非常辛苦，希望大家多鼓勵和體諒防疫團隊，給第一線同仁加油。蘇貞昌說：『(原音)這是誤會啦。行政院在院長的會議室裡面，這一年多來為了防疫，不知道開了大大小小多少次的會議，許許多多的決策都在這裡跨部會合作，共同討論出來共識。陳時中是指揮官，在第一線非常辛苦，有許多事情，他回報回來需要跨部會合作，希望各種資源整合，希望大家同步、齊一，都必須在行政院，全國最高行政機關指揮來統合、調度，做成決策。』

SARS時期和平醫院封院決策再次引發討論，蘇貞昌表示，SARS疫情從和平醫院爆發後擴及全國，成為最大的悲劇，犧牲許多醫護人員，台灣應該記取這個教訓，就是大家應該做好每一個工作，而不是推卸責任、怪來怪去。蘇貞昌表示，台灣防疫受到世界肯定最重要的原因就是全國同舟一命，現在桃園出狀況，更需要大家一起為桃園加油打氣，更不要陷入過去的錯誤。

國內疫情升溫，媒體詢問停班、停課的標準為何；蘇揆表示，中央流行疫情指揮中心的防疫工作一年多來做得很好，會依據各種狀況隨時做各種決定，希望全國同步、不要有破口。