俗稱武漢肺炎的COVID-19疫情重創全球航空，根據交通部民用航空局最新發布的統計，去年一年，就有7家外籍航空停止飛航台灣。此外，去年一年，國際及兩岸航線載客數不到900萬人次，較前年慘跌8成5，預估要到明年才可望恢復到往昔的3成運量。

根據民航局最新發布的統計，2020年國際及兩岸航線載客數僅有883萬人次，較2019年的5,958萬慘跌8成5。所幸國內航線載客數仍維持在1千萬人次，僅較前年下滑17%；國際及兩岸航線貨運量更微幅成長了5%，達到241萬噸。

值得注意的是，去年一年，共有7家外籍航空停止飛航台灣，包括法國航空、俄羅斯皇家航空、西伯利亞航空、日亞洲航空、易斯達航空、國泰港龍航空以及酷鳥航空，這還不包括廉價航空LCC在內。對此，民航局長林國顯分析，主要還是受到COVID-19疫情的影響，加上國外航空公司破產、解散、併購、重組非常頻繁，預期市場恢復之後，短程航線即可隨時恢復，只是長程航線還需再觀察。林國顯說：『(原音)法航因為它2、3年前復航以來，載客率不是很好，因為長程越洋航線非常難經營，尤其是歐洲跟美國航線，所以它們也比較快就先收掉，因為載客率沒有那麼高，再加上歐美的疫情控制不好，所以法航就先停航；像日亞航可能因為它們自己疫情的關係，你們知道，台日之間的旅客量，本來一個禮拜有700、800班，等於一天有100多班次，可是現在降到個位數啊！』

另外，在疫情影響下，客機載客的架次只有7萬3千多架次，但客機載貨不載客的架次卻達到3萬6千多架次。而類出國1.0的飛航架次也達到58架次、上萬人搭乘；不過到了類出國2.0卻只飛了4個架次、只有427人搭乘。

隨著國際疫情趨緩，各國開始陸續施打COVID-19疫苗，台灣國境也已稍微鬆綁，民航局也預估，國際及兩岸航線客運量可望在2022年恢復到2019年的3成；國內航線客運量則可望在明年完全回復到2019年的水平。