總統抵達臺東市殯葬管理所會場後,首先與大家為臺鐵408次列車事故罹難者默哀追思,隨後並進行點心燈祈福儀式,祈願逝者安息。隨後,總統就主祭者位置,與行政院長蘇貞昌及交通部長林佳龍於靈前上香、獻花、獻果,行三鞠躬禮致祭;總統並慰問罹難者家屬,給予家屬關懷及擁抱,表達深切哀悼之意。
包括行政院政務委員兼發言人羅秉成、立法委員劉櫂豪、廖國棟、臺東縣長饒慶鈴、花蓮縣長徐榛蔚等亦出席今日聯合公祭。