國立陽明交通大學近日發表一項台、日共同學術研究成果，瀕臨絕種的「台灣狐蝠」，透過次世代基因定序技術，估算出全台的有效族群數可能只剩下200多隻，相較於日本「折居式狐蝠」持續成長到近萬隻，顯示日本琉球的狐蝠族群保育，做得比台灣狐蝠好。

台灣狐蝠是台灣體型最大的蝙蝠，翼展長可達1公尺，主要食物為果實、花朵和嫩芽，原本主要分布在綠島，但在70年代幾近消失，近年在龜山島和花蓮出現穩定的小族群，是國內野生動物保育法公告的瀕臨絕種保育類野生動物；台灣狐蝠屬於琉球狐蝠的一個亞種，不同亞種分別分布在東亞島弧的各個島嶼，橫跨日本、台灣和菲律賓等3個國家。

國立陽明交通大學這次與日本琉球大學教授伊澤雅子等人合作，進行狐蝠研究，並獲得林務局和科技部的經費支持，他們分別從台北市立動物園的3隻台灣狐蝠樣本，及日本沖繩島的4隻折居氏狐蝠身上抽取DNA，透過次世代基因定序技術研究狐蝠的遺傳歧異度，並藉此推算台、日兩國狐蝠族群的數量。

主持這項研究的陽明交大助理教授可文亞指出，研究發現台灣狐蝠大約在28年前開始經歷重大族群萎縮，從等位基因頻譜上所估計的有效族群數量，從2,324隻萎縮到現在的223隻，並非自行遷移棲地，而日本沖繩島的狐蝠數量卻在3千多年間，從2,110隻成長到9,547隻，顯然日本的狐蝠族群保育得比台灣狐蝠好。

可文亞：『(原音)其實我們跟折居氏的狐蝠是非常非常不一樣的族群，所以說折居氏狐蝠可能不是一個理想的可以引進到台灣，來幫助台灣狐蝠復育的族群，我們下一步可能就要去問一下說，是不是八重山的狐蝠族群，因為牠在地理上相對接近台灣，到底能不能夠成為一個幫助台灣狐蝠保育的一個族群。』

可文亞表示，台灣狐蝠是瀕臨絕種的保育類哺乳動物，DNA非常難蒐集，且缺乏參考基因庫，這次只用7隻狐蝠就把兩個族群的歷史建構出來，其實相當有挑戰性，研究成果已發表在《遺傳》(Journal of Heredity)等國際期刊。他說，這次的研究經驗未來也能應用到其他保育類的哺乳動物，建構出更多保育類動物的族群演化史。